Viele der bekanntesten Medikamente und Substanzen enthalten Alkaloide und können unterstützend zur Behandlung verschiedenster Beschwerden eingesetzt werden:
• Morphin: Morphin wird aus Schlafmohn gewonnen und wird bei Patienten mit schweren Erkrankungen oder nach operativen Eingriffen eingesetzt.
• Chinin: Chinin, das aus der Chinarinde hergestellt wird, wurde lange Zeit zur Behandlung von Malaria verwendet. Heute wird es aufgrund von Resistenzen der Malariaerreger gegenüber dem Medikament eher selten eingesetzt.
• Atropin: Atropin kommt in der Tollkirsche (Belladonna) vor. Es wird sowohl zur Erweiterung der Pupillen bei Augenuntersuchungen verwendet als auch zur Behandlung von bestimmten Herzrhythmusstörungen eingesetzt.
• Capsaicin: Capsaicin ist ein Alkaloid, das hauptsächlich in Chilischoten vorkommt und für deren Schärfe verantwortlich ist. In der Medizin wird es oft zur Linderung von Muskelschmerzen, Arthritis und neuropathischen Schmerzen angewendet.
• Hypericin: Hypericin kommt unter anderem in Johanniskraut vor, was zur Behandlung von leichten Depressionen sowie zur Stimmungsaufhellung verwendet wird.
• Harmalin: Harmalin ist beispielsweise in der Passionsblume enthalten. In Kombination mit den Alkaloiden Passflorin und Harman kann es eine entspannende und beruhigende Wirkung auf das Nervensystem haben.